发表在第八卷第七名(2022): 7月

本文的预印本(早期版本)可在https://preprints.www.mybigtv.com/preprint/35276,首次出版
美国疾病控制与预防中心COVID-19科学更新前100版中的预印本的出版和影响:内容分析

美国疾病控制与预防中心COVID-19科学更新前100版中的预印本的出版和影响:内容分析

美国疾病控制与预防中心COVID-19科学更新前100版中的预印本的出版和影响:内容分析

短论文

通讯作者:

杰里米·奥特里奇,文学学士

疾病控制和预防中心

克利夫顿道1600号

亚特兰大,佐治亚州,30329

美国

电话:1 2406874849

电子邮件:jeremy.otridge@gmail.com


背景:预印本是公开发布到各个服务器上的未经过同行评审的手稿。尽管预印本自1961年就存在,但在COVID-19大流行期间,由于需要即时的相关信息,预印本越来越受欢迎。

摘要目的:本研究的目的是评估美国疾病控制和预防中心(CDC) COVID-19科学更新中包括的预印本的出版率和影响,并评估COVID-19科学更新团队在选择有影响力的预印本方面的表现。

方法:《科学更新》前100版(2020年4月1日至2021年7月30日)的所有预印本都包括在这项研究中。未出版的预印本被归类为“未出版的预印本”。随后发表的预印本有两个版本(在同行评审期刊上和原始预印本服务器上),分别进行分析,并分别称为“同行评审预印本”和“原始预印本”。发表时间是指预印本第一次发表的日期与它第一次作为同行评审文章发表的日期之间的时间间隔。2021年8月6日,所有可用手稿的影响由Altmetric注意力评分和引用计数量化。预印本通过出版状态、出版率、预印本服务器和出版时间进行分析。

结果:在研究期间,CDC COVID-19科学更新中包含的275份预印本中,大多数来自三个服务器:medRxiv (n=201, 73.1%)、bioRxiv (n=41, 14.9%)和SSRN (n=25, 9.1%),还有8份(2.9%)来自其他来源。另外,152篇(55.3%)最终发表。中位发表时间为2.3 (IQR 1.4-3.7)。如果不包括过去2.3个月发布的预印本(考虑到出版时间),出版率为67.8%。此外,有76种期刊发表了至少一种来自CDC COVID-19科学更新的预印本,18种期刊发表了至少三种预印本。未发表预印本的Altmetric注意评分中位数(n=123, 44.7%)为146 (IQR 22-552),中位数引用数为2 (IQR 0-8);原始预印本(n=152, 55.2%)分别为212 (IQR 22-1164)和14 (IQR 2-40);对于同行评审预印本,这些值分别为265 (IQR 29-1896)和19 (IQR 3-101)。

结论:此前对COVID-19预印本的研究发现,出版率在5.4%至21.1%之间。美国疾病控制与预防中心COVID-19科学更新中包括的预印本的出版率高于总体的COVID-19预印本,最终出版的预印本在几个月内出版,比未出版的预印本获得了更高的关注得分。这些发现表明,就预印本发表的可能性和影响而言,科学更新选择预印本的过程具有很高的保真度。将高质量预印本纳入疾控中心2019冠状病毒病科学更新,提高了这项活动为有意义的公共卫生决策提供信息的能力。

JMIR公共卫生监测2022;8(7):e35276

doi: 10.2196/35276

关键字



预印本是公开的,非同行评审的文章,发布在各种服务器上,如medRXiv和bioRxiv。1961年,预印本作为信息交换组首次出现。然而,由于期刊的抵制,信息交换小组于1967年关闭[1].1991年,一个后来成为arXiv的自动电子邮件服务器建立了,这是一个流行的现代预印本服务器[1].2019年,冷泉港实验室与耶鲁大学合作推出medRxiv [1].在2019冠状病毒病大流行期间,由于需要快速、相关的信息来应对大流行,预印本得到了广泛的欢迎和信任。为了帮助公共卫生应对COVID-19,美国疾病控制和预防中心(CDC)创建了COVID-19科学更新[2].

COVID-19科学更新简要概述了与COVID-19相关的新文章,主题包括卫生公平、疫苗、变体、自然史和检测等[2].为了提供最相关和及时的信息,《COVID-19科学更新》包括已发表(同行评议)的文章和手稿预印本。Stephen B. Thacker疾控中心图书馆与世界卫生组织(世卫组织)合作,每天对所有与COVID-19有关的文章进行系统(详尽、可重复和可防御)搜索,然后对这些文章进行清理和重复删除,将其纳入世卫组织COVID-19数据库。创建该数据库的完整搜索策略可在世卫组织COVID-19数据库网站上找到[3.].生成的文章被发送给美国疾病控制与预防中心COVID-19应对措施内的科学更新团队,该团队然后选择关于美国疾病控制与预防中心COVID-19科学议程中公共卫生优先主题的同行评议文章和预印本[4]和疾控中心COVID-19应对卫生公平战略[5].

2019冠状病毒病科学更新从2020年4月开始试行,每两周发布一次,自2020年9月起公开发布(以前的版本追溯发布在互联网上)[2].2020年11月,公开发布变成每周一次,2021年2月开始提供电子邮件订阅。该分析的目的是评估发表率(在同行评议期刊上发表预印本的百分比)和影响(例如,Altmetric注意评分[6]和引用数),并评估COVID-19科学更新团队在选择有影响力的预印本方面的表现。


本次分析包括前100版(2020年4月1日至2021年7月30日)的所有预印本。一些预印本最终出版了(归类为“同行评议预印本”),而另一些则没有出版(归类为“未出版预印本”)。发表时间是指预印本第一次发表的日期与它第一次作为同行评审文章发表的日期之间的时间间隔。2021年8月6日,使用Altmetric注意力评分(从学术、新闻和社交媒体来源获得的注意力的加权衡量)和引用计数(也来自Altmetric)对所有可用文章(是否经过同行评审)的影响进行了量化(中位数和四分位数范围)。对于同行评议的预印本,影响指标仅衡量出版后积累的影响。为了有时间发布预印本并积累影响,我们限制了与2019冠状病毒病科学更新2020年版(至第70版)中包含的项目的比较。在Minitab中进行统计学比较(情绪中位数检验)P<。0.05为有统计学意义。预印本通过出版状态、出版率、预印本服务器和出版时间进行分析。


在《COVID-19科学更新》的1971篇文章中,有275篇(14%)是预印本(图1),其中大部分来自以下3个服务器中的1个:medRxiv (n=201, 73.1%), bioRxiv (n=41, 14.9%),或带有SSRN的Lancet预印本(n=25, 9.1%),还有8个(2.9%)来自其他来源。超过一半(152/ 275,55.3%)在分析期内(2020年4月1日至2021年8月6日)发表。中位发表时间为2.3个月(IQR 1.4-3.7)。如果不包括过去2.3个月发表的预印本(考虑到发表时间),发表率为67.8%(143/211)。《COVID-19科学更新》中包括的预印本发表在76种不同的期刊上,18种期刊至少发表了3种。此外,有2家期刊(New England Journal of Medicine and Clinical Infectious Diseases)分别发表了11份预印本。

纳入COVID-19科学更新的同行评议文章(n=1696)的Altmetric注意力评分中位数为365 (IQR 64-1316),引用数中位数为33 (IQR 9-111) (表1).对于同行评议的预印本(n=152), Altmetric注意评分中位数为265 (IQR 29-1896),引用数中位数为19 (IQR 3-101)。对于未发表的预印本(n=123), Altmetric注意评分中位数为146 (IQR 22-552),引用数中位数为2 (IQR 0-8)。

为了解释文章公开可获得的时间差异,分析样本仅限于2020年版《2019冠状病毒病科学更新》(至第70版;表1).73篇预印本中,已发表50篇(68.4%)。已发表文章的Altmetric注意得分中位数(328,IQR 57-1224)高于未发表预印本(83,IQR 9-231;P= .002)。同行评审(260,IQR 43-1817)和未发表预印本之间的Altmetric注意评分差异不具有统计学意义,可能是由于样本量小(P= .09点)。同行评议预印本(55,IQR 9-148)和已发表文章(43,IQR 15-149)的引文中位数显著较高(P<.001)高于未出版预印本(4,IQR 1-9)。同行评议预印本与已发表文章的引用数无显著差异(P= 23)。

图1。美国疾病控制与预防中心(CDC) COVID-19科学更新前100版(2020年4月至2021年7月)中包含的文章类型的细分。左边的饼显示预印本和已发表文章的总数。右边的饼状图显示了截至2021年8月6日,左边的饼状图中有多少预印本得到了同行评审或仍未发表。
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表1。截至2021年8月6日,美国疾病控制与预防中心(CDC) COVID-19科学更新前100版(2020年4月至2021年7月)中文章和预印本的Altmetric注意力得分中位数和引用数。
文章类型 物品,n (%) Altmetric注意评分中位数(IQR) 引文中位数n (IQR)
版本1 - 100

总计 1971 324 (56 - 1249) 28日(7 - 93)


发表 1696 (86) 365年(64 - 1316) 33 (9 - 111)


预印本 275 (14) 174 (22 - 899) 6(1至29)



同行评议一个 152 (8) 265 (29 - 1896) 19 (3 - 101)



未发表的 123 (6) 146 (22 - 552) 2(主)
版本1-70(2020年),考虑到时间积累的影响

总计 1213 312 (55 - 1194) 43 (14 - 147)


发表 1140 (94) 328 (57 - 1224)b 43 (15 - 149)b


预印本 73 (6) 150 (25 - 866) 15 (4 - 72)



同行评议一个 50 (4) 260 (43 - 1817) 55 (9 - 148)b



未发表的 23日(2) 83 (9 - 231) 4 (1 - 9)

一个这些论文有两个版本:保留在预印本服务器上的原始预印本和发表在期刊上的同行评议版本

bP<。未发表预印本的Altmetric注意评分或引用数差异为05。仅对版本1-70中的文章进行了测试,以考虑文章积累影响的时间差异。


此前对COVID-19预印本的分析发现,出版率在5.7%至21.1%之间[78].《2019冠状病毒病科学更新》中包括的预印本的出版率高于其他地方报告的出版率[78,而那些最终出版的书比未出版的预印本获得了更高的关注分数。高Altmetric关注分数仅表示出版物所受到的总关注。它不区分积极和消极的关注,因此高Altmetric注意得分可以同样反映一篇具有高科学价值的出版物或一篇被广泛驳斥的出版物[6].预印本有助于快速获取信息;然而,它们最终会受到缺乏同行评审的限制,因此可能会发生变化,可能永远不会发表。因此,辨别高质量、有影响力的预印本的能力是公共卫生决策的重要工具。尽管存在这些限制,但我们的分析结果表明,COVID-19科学更新选择预印本的过程是稳健的,就预印本发表的可能性和影响力而言,保真度很高。将高质量预印本纳入《2019冠状病毒病科学更新》,可提高这项活动提供及时信息的能力,从而对有意义的公共卫生决策产生影响。

致谢

该项目部分得到橡树岭科学与教育研究所通过美国能源部和疾病控制与预防中心之间的跨部门协议管理的疾病控制与预防中心(CDC)研究参与计划的任命(JO)的支持。作者要感谢美国疾病控制与预防中心COVID-19应对措施首席医疗官办公室内的科学更新团队。

免责声明

本报告中的发现和结论是作者的观点,并不代表疾病控制和预防中心的官方立场。

利益冲突

除了JO之外,所有作者都是美国政府雇员(CDC), JO是ORISE的研究员,被安置在CDC的图书馆科学办公室。

  1. 《生物预印本的史前史:20世纪60年代被遗忘的实验》。PLoS biology 2017 11月16日;15(11):e2003995 [免费全文] [CrossRef] [Medline
  2. COVID-19科学更新。疾病控制和预防中心。URL:https://www.cdc.gov/library/covid19/scienceupdates.html[2022-07-11]访问
  3. 世卫组织COVID-19研究数据库:用户指南和信息。世界卫生组织。URL:https://www.who.int/publications/m/item/quick-search-guide-who-covid-19-database[2021-10-14]访问
  4. 疾控中心COVID-19公共卫生科学议程。疾病控制和预防中心。URL:https://www.cdc.gov/coronavirus/2019-ncov/science/science-agenda-covid19.html[2022-07-12]访问
  5. 卫生公平:促进公平获得卫生服务。疾病控制和预防中心。URL:https://www.cdc.gov/coronavirus/2019-ncov/community/health-equity/index.html[2022-07-12]访问
  6. Altmetric是做什么的?Altmetric。URL:https://www.altmetric.com[2021-10-19]访问
  7. Añazco D, Nicolalde B, Espinosa I, Camacho J, Mushtaq M, Gimenez J,等。COVID-19大流行期间发布的预印本的出版率和引用数:好的、坏的和丑陋的。PeerJ 2021;9:e10927 [免费全文] [CrossRef] [Medline
  8. 李文杰,李志强,李志强,刘志强,等。Pálfy预印本在COVID-19研究传播中的不断变化的作用及其对科学传播格局的影响。科学通报2021年4月19日(4):e3000959 [免费全文] [CrossRef] [Medline


疾病预防控制中心:疾病控制和预防中心
人:世界卫生组织


H Bradley编辑;提交29.11.21;S Arnesen, D Hu, I Mircheva同行评审;对作者24.02.22的评论;修订版本收到01.03.22;接受10.05.22;发表15.07.22

版权

©Jeremy Otridge, Cynthia L Ogden, Kyle T Bernstein, Martha Knuth, Julie Fishman, John T Brooks。原载于JMIR公共卫生与监测(https://publichealth.www.mybigtv.com), 15.07.2022。

这是一篇根据创作共用署名许可协议(https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/)发布的开放获取文章,允许在任何媒介上不受限制地使用、分发和复制,前提是正确引用了首次发表在JMIR公共卫生和监测上的原创作品。必须包括完整的书目信息,https://publichealth.www.mybigtv.com上的原始出版物的链接,以及此版权和许可信息。


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